1．缺乏创新型人才。科技创新渴求领军人物。领军人物，能够带领科研团队攀登制高点，并懂得将科研成果成功地转化为生产力；领军人物，能够带领企业走自主创新之路。这样既懂技术，又熟知产业化运作的顶级人才。
2．从投入来看，政府部门正不断加大对科技创新的投入，但企业对科技创新投入积极性还不够高。有限的投入目标还不够集中。
3．在与创新相关的市场上，信息流动不够活跃。在这个平台上，大学、科研院所应展示自己有什么能力；企业应积极提出对于科技研发有何需求。目前，大学与科研院所寻求合作的积极性比较高，但许多企业在这方面意识不强。
4．企业作为科技创新的主体地位还不突出。不少企业目光短浅，创新动力不足。有些企业在年度预算中不重视研究开发费用的预留。有些企业在搞产学研项目时，指望政府拨款。
原因：
1．长期以来，我们的高校、科研院所、企业在不同轨道运行，能深入结合的不多。
2．对于知识产权的保护，技术人才的流动，企业产权的明晰等制度安排上存在的问题，在相当大的程度上抑制了创新活动的展开。
3．企业没有成为创新的主体。我们国家的专利发明主题大多数是科研院所和个人，他们无法独资承担起科技发明的投入，也无法承担起科技发明所具备的一些供销。但是另一方面我们国家大概有80％以上的企业却没有自己的专利，科研院所、个人和企业的错位使大量专利没有办法转化的一个重要的原因。很多人都说中国人聪明，老百姓当中确实有不少心灵手巧的能人，但是如果不让企业真正地担当起创新的主角，不能让创新的机制真正运行到位，那么老百姓的创新力再强，也没有办法转化成国家的创造力。
科技创新的对策：
1．自主创新，必须注重专利申请，尤其是发明专利，在知识产权这一高台上与国外较量。要更加鼓励发明、创造、创新，使知识产权成为促进国民经济发展的重要手段。只有这样，我们才能制定科学的知识产权战略和政策，理顺知识产权的管理体制和机制。 2．进行“创新型”教育体系改革。在科技创新的基础条件中，最重要的恐怕是教育体系。中国的传统教育体系偏重于知识传授，厚重有余，活力不足，在某种意义上不利于创造能力的形成。中国的教育在课程设置、教授方式、考评方式等方面均有诸多待兴待革之处。
3．政府要提供有效的制度支持。国家对自主科技创新的制度支持应是全面